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上海交通大学医学院呼吸内科是专业博士后、博士、硕士培养点，是重点学科、卫生部专科医生培训基地。高级职称23人；中级职称11人；初级职称13人；护士66人；目前有博士后导师3人，博导4人，硕导8人，90%具有硕士生及以上学历。科室编制总床位数张，其中包括特需病房1个，普通病房3个；年门诊量人次/年，年住院量人次/年。
呼吸内科是以肺部疾病的鉴别诊断、肺癌多学科综合治疗为特色的集医、教、研为一体的科室。科室设有呼吸科普通病房、呼吸内镜介入中心、肺功能室、日间化疗病房及呼吸重症监护室。
呼吸内科的优势及特色技术包括肺内孤立小病灶诊治、肺部肿瘤个体化诊治及多学科综合治疗、呼吸系统疾病的新药临床研究、呼吸重症抢救及肺移植、肺部介入呼吸病学临床应用等。
科室近5年获得国家级及省部级等课题资助近百项。目前承担科技部重大专项“国产电磁导航系统的早期肺癌精准诊疗技术研究”、上海市卫生系统联合攻关项目“早期肺癌社区筛查”等重大课题。发表论文多篇，文章发表于JAMAOncol、ERJ、AdvanSci、AnnOncol、JTO、BMJ及CancerResearch等知名期刊。曾获中华医学科技进步二等奖、上海市医学科技进步二等奖。开展药物临床试验余项，参与及主导多项国际多中心研究，包括IPASS、IGNITE、MO、CA-、BPI-、LEAP-、JO、MO等，积极参与并设计了数项抗癌新药临床试验。年在国内主持开展了晚期非小细胞肺癌小分子多靶点酪氨酸激酶抑制剂安罗替尼的临床注册研究，年获国家药品监督管理局批准为第一种晚期非小细胞肺癌三线的标准治疗方法。呼吸病学位居医院科研竞争力评价学科排行榜第一名。
科室致力于肺癌的规范化及学术平台的建设，编写完成了版及、版“中华医学会肿瘤学分会肺癌临床诊疗指南”，编写牵头发布了《晚期非小细胞肺癌抗血管生成药物治疗中国专家共识（版）》。
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